{"id":538,"date":"2026-01-21T18:51:48","date_gmt":"2026-01-21T17:51:48","guid":{"rendered":"https:\/\/www.icp.universite-paris-saclay.fr\/capri\/?page_id=538"},"modified":"2026-01-21T18:55:19","modified_gmt":"2026-01-21T17:55:19","slug":"sainbiosis-project","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.icp.universite-paris-saclay.fr\/capri\/en\/sainbiosis-project\/","title":{"rendered":"SAINBIOSIS project"},"content":{"rendered":"

Study of interactions S-pi in peptides \u2013 SAINBIOSIS project<\/h3>\n
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Debora Scuderi (PR), Jean-Xavier Bardaud (Post Doc), Fernanda Ross (Doc)
\nAlumni :\u00a0 Yining Jiang (Doc)<\/p>\n<\/div>\n<\/div><\/div><\/div>

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Le projet SAINBIOSIS (Sulfur-Aromatic INteraction in BIOmolecules: Structural Investigations and Spectroscopy) est un projet en collaboration avec DESY \u00e0 Hambourg en Allemagne (Lucas Schwob et Sadia Bari), financ\u00e9 par l\u2019ANR (mai 2024-mai 2027).
\nDans le cadre de l\u2019ANR internationale SAINBIOSIS on s\u2019int\u00e9resse \u00e0 l\u2019\u00e9tude de l\u2019interaction S-pi dans les peptides.<\/p>\n

Contexte.<\/strong> Des \u00e9tudes de bio-informatique r\u00e9centes sur les bases de donn\u00e9es des structures des prot\u00e9ines ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 qu\u2019un tier de toutes les prot\u00e9ines connues ont leur structure stabilis\u00e9e par des interactions non covalentes aromatiques : l\u2019interaction S-pi. Ces groupes S-pi servent aussi comme station relais dans le processus de transport d\u2019\u00e9lectrons au sein des prot\u00e9ines. La pertinence biologique de cette interaction est aussi due \u00e0 son implication dans des pathologies associ\u00e9es \u00e0 sa perte suite \u00e0 l'oxydation des soufres, telles que la maladie d\u2019Alzheimer et de Creutzfeldt-Jacob.
\nL\u2019\u00e9tude des interactions S-pi gagnent actuellement en int\u00e9r\u00eat dans de nombreux secteurs de recherche, tel que les m\u00e9dicaments pour les th\u00e9rapies cibl\u00e9es, les catalyseurs organiques, ou encore la compr\u00e9hension de la structure et de la fonction de biomol\u00e9cules.
\nAujourd\u2019hui, cependant, il n\u2019existe pas de donn\u00e9es spectroscopiques permettant d\u2019identifier l\u2019interaction S-pi.<\/p>\n<\/div>\n<\/div><\/div>

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Models d\u2019interaction S\u2234\u03c0 \u237a-helix (gauche) and \u03b2-hairpin (droite) entre le trypthoophane et la methionine.<\/em><\/p>\n<\/div>\n<\/div><\/div>

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Objectif du projet.<\/strong> Ce projet vise \u00e0 \u00e9tudier la signature spectrale de l\u2019interaction S-pi qui apportera des informations sur la structure \u00e9lectronique, les transferts de charges et autres propri\u00e9t\u00e9s dans les prot\u00e9ines, et constituera aussi un marqueur biologique de la d\u00e9naturation d\u2019une prot\u00e9ine pour la d\u00e9tection pr\u00e9coce de certaines pathologies. Avec ce projet, nos \u00e9quipes emploieront des m\u00e9thodes spectroscopiques de pointe (spectroscopie IR, UV, VUV, rayons-X), en combinaison avec des techniques de spectrom\u00e9trie de masse, pour identifier et caract\u00e9riser l\u2019interaction S-pi dans des peptides et des prot\u00e9ines ainsi que pour \u00e9valuer les effets de l\u2019oxydation des soufres sur la d\u00e9naturation des prot\u00e9ines et la signature spectroscopique.
\nDes calculs th\u00e9oriques, traitant de fa\u00e7on ab initio l\u2019interaction S-pi et par m\u00e9canique mol\u00e9culaire le reste de la mol\u00e9cule, serviront de support aux exp\u00e9riences.
\nMoyennes. Un nouvel instrument a \u00e9t\u00e9 install\u00e9 au sein de la plateforme de spectroscopie IR (SMAS\/CLIO) gr\u00e2ce au financement ANR, le Photosynapt. Le PhotoSynapt est bas\u00e9 sur un instrument commercial de la soci\u00e9t\u00e9 Waters (le Synapt G2) modifi\u00e9 et install\u00e9 au sein de la plateforme de spectroscopie IR d l\u2019ICP. La modification comprend des modifications du syst\u00e8me de vide par l'ajout d'une chambre \u00e0 vide suppl\u00e9mentaire avec transfert hexapolaire et pi\u00e8ges \u00e0 aiguilles, ainsi qu'un acc\u00e8s optique pour les lasers. Le syst\u00e8me est \u00e9galement capable d'effectuer un d\u00e9coupage bas\u00e9 sur le temps de d\u00e9rive pour s\u00e9lectionner des conform\u00e8res sp\u00e9cifiques.
\nDans le cadre de ce contrat ANR un post-doctorat de deux ans et une th\u00e8se de 3 ans accompagnera le projet (2025-2028). Lucas Schwob a \u00e9galement obtenu un poste de professeur invit\u00e9 \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 Paris Saclay dans le cadre de ce projet ANR PRCI (Novembre 2024).
\nLe Photosynapt est ouvert aux utilisateurs de la plateforme SMAS\/CLIO et gr\u00e2ce au financement obtenu en vague 2 par le PEPR-LUMA il sera impl\u00e9ment\u00e9 avec un pi\u00e8ge refroidi \u00e0 basse temp\u00e9rature ce qui permettra d\u2019ouvrir des nouvelles applications \u00e0 CLIO.<\/p>\n

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Collaborations<\/h3>\n
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Chantal Hou\u00e9e-Levin (CPSysBio, ICP), Lucas Schwob et Sadia Bari (DESY, Hambourg)<\/p>\n<\/div>\n<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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