Protéines fluorescentes et biosenseurs pour l’imagerie
Yasmina. Bousmah (AI), Marie Erard (PR), Oliver Nüsse (PR), Hélène Pasquier (MCF-HDR), Théo Beguin (Doc 22- ) Dounia Zamiati (Doc 21-)
Alumni : Fabienne Merola (DR retraite en 2020), Hana Illichova Valenta (Doc 17-20), Mouna Abdesselem (Post Doc 20-22)
La description fine des fonctions physiologiques nécessite la compréhension en temps réel de l’organisation et de la communication cellulaire. Pour atteindre cet objectif, l’imagerie de fluorescence est un outil de choix, avec en particulier l’utilisation de sondes telles que les protéines fluorescentes de la famille de la GFP. Ces protéines présentent l’avantage d’être codées génétiquement et parfaitement biocompatibles. Nous contribuons au développement de nouvelles protéines fluorescentes, essentiellement de couleur cyan et jaune, que nous utilisons pour étudier divers phénomènes biologiques, notamment via le transfert résonant d’énergie de type Förster (FRET) et sa détection par durée de vie de fluorescence (FLIM).
Nos projets nécessitent un environnement permettant de réaliser des expériences allant de la biochimie, de la biologie moléculaire et cellulaire aux études photophysiques in vitro et jusque à l’imagerie de fluorescence disponible sur le plateau technique SpICy.
Structure des protéines fluorescentes et de leur chromophore. Images confocales de protéines fluorescentes adressées à la membrane, Aquamarine à gauche ([Erard2013], Addgene: pAquaN1, Plasmid #42888, pProEX-Aqua, plasmid#42889) et de tdLanYFP à droite [Bousmah2021].
Nos activités se déclinent en 3 volets :
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- la compréhension, au niveau fondamental, des relations structure - propriétés photophysiques et photochimiques dans les protéines fluorescentes pour l’ingénierie de nouvelles protéines fluorescentes aux performances améliorées
- le développement de biosenseurs codés génétiquement
- la mise au point de méthodes analytiques en cellule vivante basées sur la spectroimagerie de durée de vie de fluorescence (FLIM et FLIM-FRET)
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Collaborations
Frederic Halgand (CAPRI, ICP, Orsay), Fabien Cailliez (TheoSim, ICP, Orsay), Agathe Urvoas (I2BC, Gif sur Yvette), Giulia Bertolin et Marc Tramier (IGDR, Rennes), Patrick Berthault (CEA, Saclay), Francois Brecher (CEA, Saclay), Nathalie Westbrook (LCF, Palaiseau), Catherine Berthomieu (CEA, Saint Paul Lez Durance), Francesca Giordano (I2BC, Gif sur Yvette), Cyrille Botté (IAB, Grenoble)