Le groupe CPSysBio
Le groupe CPSysBio, dirigé par Oliver Nüsse depuis 2021, est constitué d’une trentaine de personnes, incluant chercheurs, enseignants-chercheurs et non-permanents. Les chercheurs du groupe sont organisés en 6 équipes scientifiques soutenues par une équipe technique qui mène également des missions transverses (équipements communs, gestions de commandes et produits, sécurité).
Les ITAs et BIATSS du groupe CPSysBio
James Beauvil (T) participe majoritairement aux activités liées aux conséquences des rayonnements ionisants sur les objets biologiques dans l’équipe Rayonnement ionisant, Biosystèmes et Nanoparticules
Yasmina Bousmah (AI) s’intéresse à l’ingénierie des protéines fluorescentes et appuie l’équipe Protéines fluorescentes et biosenseurs pour l’imagerie.
Valérie Derrien (IE) concentre ses activités sur l’étude des relations structure-fonction dans la famille des globines in vitro dans l’équipe Exploration des fonctions biologiques des globines
Céline Férard (AI) participe à plusieurs projets dans les équipes Rayonnement ionisant, Biosystèmes et Nanoparticule et Exploration des fonctions biologiques des globines
Hadrien Jalabert (AI) accueille les utilisateurs sur le plateau technique SpICy et soutient l’équipe Signalisation dans les phagocytes.
Jérémie Mathurin (IR) est responsable de la plateforme MUSIICS dans l’équipe Micro-spectroscopie AFMIR
Les équipes du groupe CPSysBio
Protéines fluorescentes et biosenseurs pour l’imagerie
Hélène Pasquier (MCF-HDR), Marie Erard (PR), Théo Beguin (Doc 22-, ) Dounia Zamiati (Doc 21-), Lea Madegeard (Post Doc 23-25, contrat partagé avec l’ICMMO).
Alumni : Fabienne Merola (DR retraite en 2020), Hana Illichova Valenta (Doc 17-20, actuellement Post Doc KU Leuven), Mouna Abdesselem (Post Doc 20-22, travaille au Ministère des Solidarités)
Nous explorons le lien entre la structure des protéines fluorescentes et leurs propriétés photophysiques et photochimiques afin d’en proposer de plus performantes. Nous développons aussi des biosenseurs pour l’imagerie et des méthodes analytiques basées sur le phénomène de fluorescence pour suivre les interactions protéine-protéine en cellule vivante. Nous animons l’axe Protéines fluorescentes et biosenseurs pour l’imagerie mais sommes aussi impliqués dans des projets qui concernent la NADPH oxydase et plus généralement le stress oxydant et les systèmes biologiques.
Dynamique et fonctionnement de protéines redox et stress oxydant
Laura Baciou-Partiseti (DR), Tania Bizouarn (CR-HDR), Chantal Houee-Levin (PREM), Florence Lederer (DR bénévoleXavier Serfaty (Post Doc 22-25, contrat partagé avec l’I2BC)
Alumni : Xavier Serfaty (Doc 15-18, actuellement Post Doc ICP-I2BC), Aicha Bouraoui (Doc 16-19, actuellement Consultante chez Business & Decision Life Sciences), Stephenson Boakye Owusu (Doc 18-21, actuellement volunteer at Rape Victim Advocate), Dina Al Abyad (Doc 19-22, actuellement Post Doc à l’Institut J. Monod), Sana Aimeur (Doc 20-23, actuellement Co-Head/COO à Esterlab Tech)
Notre motivation est d’obtenir une description moléculaire dynamique détaillée de protéines rédox en nous intéressant à leur structure, leur dynamique structurale, leur assemblage/désassemblage, migration à la membrane et leurs propriétés physico-chimiques. Nos recherches s’adressent à des protéines rédox membranaires et solubles (telles que les NADPH oxydases, flavohémoglobines, flavoenzymes) avec lesquelles nous développons des outils biologiques variés (fractionnement de phagocytes, protéines membranaires recombinantes, liposomes (SUV/GUV), nanoparticules, nanodisques) en utilisant des techniques de biologie moléculaire et de biochimie. Pour les étudier, nous combinons des méthodes spectroscopiques (absorption et fluorescence stationnaire et résolue en temps, stopped-flow) avec des approches structurales (cristallographie, SAXS, dichroïsme circulaire) en prenant avantage des développements de l’intelligence artificielle (AlphaFold). Nos travaux couvrent notamment le rôle de la membrane biologique, les mécanismes de transferts d’électrons, les assemblages protéiques, ainsi que l’impact du stress oxydant sur la réponse immunitaire.
Rayonnement ionisant, Biosystèmes et Nanoparticules
Cécile Sicard-Roselli (PR)
Alumni : Emilie Brun (MCF en disponibilité à University of Birmingham depuis 2023), Florent Ducrozet (Doc 19-22, actuellement MCF Université Paris Saclay), Anouchka Gatin (Doc 19-22, actuellement Spécialiste Applications chez Waters Corporation), Fanny Mousseau (Post Doc 18-19, actuellement Ingénieur CEA)
Nos thèmes de recherche concernent l’impact du stress oxydant sur des protéines et l’application des nanoparticules et matériaux en thérapie, dosimétrie ou encore catalyse. Nous portons ainsi l’axe physico-chimie des nanoparticules et matériaux et contribuons à l’axe stress oxydant et systèmes biologiques.
Signalisation dans les phagocytes
Oliver Nüsse (PR), Dounia Zamiati (Doc 21-)
Alumni : Sophie Dupré-Crochet (PR à l’Université Versailles Saint Quentin depuis 2024) Salomé Laurans (Doc 20-24, actuellement Post Doc à l’IGR) Alexandra Zak (Doc 16-19, maintenant R&D chez Michelin), Jérémy Joly (Doc 16-19, actuellement enseignant)
Nous étudions les voies de signalisation qui contrôlent la phagocytose et la destruction de pathogènes par les phagocytes, notamment la production de ROS par la NADPH oxydase. Nous utilisons principalement des cellules PLB985 différenciées en un phénotype analogue à celui des neutrophiles. Contrairement aux neutrophiles humains primaires, les cellules PLB985 peuvent être génétiquement modifiées pour surexprimer ou supprimer des protéines spécifiques. Des techniques majeures sont par la microscopie à fluorescence (vidéo microscopie, spinning disc, FRET-FLIM, dSTORM etc) et cytométrie de flux avec des cellules exprimant des sous-unités de l'oxydase marquées par des protéines fluorescentes.
Exploration des fonctions biologiques des globines
Sophie Bernad (MCF), Cécile Bouton (DR)
Alumni : Delphine Onidas (MCF, Université Paris Descartes), Pierre Sebban (PR retraite en 2020)
Nos activités s’intègrent dans l’axe stress oxydant et systèmes biologiques. Nous nous intéressons à la fonction biologique de protéines de la famille des globines afin d’évaluer l’impact de paramètres physicochimiques et biochimiques sur la structure des globines. Nous explorons aussi le rôle de la neuroglobine dans les cellules cancéreuses.
Nano-spectroscopie AFMIR
Dominique Bazin (DR), Alexandre Dazzi (PR), Ariane Deniset-Besseau (MCF), Antoine Vite (Doc 23-), Laure Bejach (Doc 21-), Thi Quynh Tran (Post-Doc), Carla Collange (Doc 24-).
Alumni : Jérémie Mathurin (Doc 15-19, actuellement IR ICP), Margaux Petay (Doc 20-23, actuellement Post Doc Université TU Wien ), Jehan Waeytens (18-22, actuellement Assistant Professor at ULB), Denys Benedis (Doc 20-23,), Ece-Neslihan Aybeke (Post Doc 17-18)
Nos thématiques de recherche s’articulent autour de la caractérisation chimique de matériaux complexes à l’échelle nanométrique, par nanospectroscopie infrarouge, AFM-IR. Notre équipe est pionnière dans ce domaine grâce au développement et au brevetage en 2007 de cette technologie par Alexandre Dazzi, fondateur de notre équipe. L’AFM-IR est le résultat d’un couplage entre la microscopie à force atomique (AFM) et la spectroscopie infrarouge (IR), offrant la possibilité de repérer et d’identifier à l’échelle nanométrique des composants organiques et inorganiques au sein d’un échantillon micrométrique. Nous disposons de quatre de ces instruments, regroupés au sein de la plateforme MUSIICS (MultiScale Infrared Imaging platform for Complex Systems). Cela nous permet de collaborer aussi bien avec des partenaires académiques qu’industriels, sur des thématiques allant de l’astrochimie à la biophysique tout en proposant de nouveaux développements instrumentaux.